А в чём проблема с верой?
Проблема возникает тогда, когда вера подсовывает ответ, который хотелось бы получить в исследованиях. И что тогда исследовать, если ответ вот он готов уже? В особенности если вера опирается на негативную эмоцию, и сомнение ей ох как вредно (а вдруг исследование выявит, что ответ, подсунутый верой был не верен).
Проблема, также, возникает когда вера, например, говорит, что есть некая всемогущая, и не предсказуемая сила, которая может в любом эксперименте, дать любой результат. И как тут выкрутиться кроме как насильно ограничив свою веру?
А вот так, если человек смотрит на научный данные сквозь призму своей философской системы.
Ну что? Эта Ваша "призма" даёт "понимание", "ощущения", даёт основу, для формирования языка и терминологии, помогает выбирать направление дальнейшего поиска, и прочее прочее... Если кто использует "призму", значит ему это на пользу. В чём проблемы?
псевдорелигия означает, что человек опирается на какую-то систему как религию, как базис мировоззрения. Сам человек и определяет куда что у него движется. 
Петро уже ответил.
А я опять развиваю свой вопрос: Почему именно на систему как религию, а не на религию как систему? Попытайтесь понять вопрос.
Вы, кстати, начали читать книгу, активно рекомендуемую DLed`ом ?