На самом деле, я думаю, что со стороны пропаганды атеизма самому атеизму наносится неизмеримо больший вред, чем со стороны религий. Дело в том, что любая пропаганда априори ведет к вульгаризации (это неизбежно при распространении сложного учения, потому что не все его могут понять) и догматизации (среди тех, кто переходит в лагерь атеистов есть люди, и их довольно много, которые воспринимают атеизм как очередную религию). СССР тому яркий пример. Советский атеизм - это форма религии со всеми ее атрибутами.
Первично тут качественное естественнонаучное и общегуманитарное образование. Умные, критически мыслящие люди, способные подвергать установки, преподносимые им, нормальной здоровой критике - это лучшая защита от всех социальных болезней типа нынешней клерикализации.