Свитки Кумрана и Хаммады никакого влияния на это не оказывали, т.к. мирно покоились в земле и пещерах.
Суть не в том, что они оказали влияние, а в том, что существовало определённое развитие письменной традиции, которое не прерывалось. А то, что тексты постоянно переписывались и видоизменялись в процессе - это обычное дело.
В некоторых местах варианты кумранских рукописей отличается от массоретского текста, в некотрых совпадает, точно так же и с Септуагинтой. Но, если брать христианские тексты, которые переписывались постоянно, начиная со 2 го века, то там такая же фигня. Не возможно переписать от руки огромный текст с точностью до буквы, иногда осознанно или неосознанно даже смысл подправляется.
Я не знаю, с чего вы взяли, что римляне вычистили все еврейские тексты. Во-первых, еврейских общин было по всему древнему миру огромное количество и у всех были свои рукописи, во-вторых, в Масаде же сохранились тексты, хотя эту крепость взяли римляне в 73 году.
Честно говоря, вообще не слышал такого, чтобы римляне целенаправленно занимались розыском и уничтожением чьей-то писанины. Какие-то источники об этом упоминают? Это христиане потом, когда пришли к власти, этим начали заниматься, уничтожая тексты конкурирующих религиозных групп.