каким образом можно создать дубль молекулы
Все МОЛЕКУЛЫ одного вещества одинаковы с точностью до как раз возбуждённого/невозбуждённого состояния, но в одинаковом состоянии они не различаются.
Законы квантовой механики на молекулы уже не распространяются, они даже на атомы не распространяются, их сфера применимости -- исключительно элементарные частицы.
Фишка КМ в том, что элементарные частицы имеют природу волны, но фиксированного "размера", потому их и обозвали квантами (т.е. порциями).
Создать или поглотить можно только определённую порцию -- квант, меньше или больше нельзя, только кратное количество. Это роднит их с корпускулами, но вот движутся они как волны и уравнения их движения -- это уравнения, описывающие распространение волн.
Отсель и непонятки, вытекающие с одной стороны из того, что все замеры свойств э/частиц исключительно инвазивны, т.е. по действию сей частицы на что-нибудь (краш-тест, по-простому), а с другой из-за как раз волновой природы.
Ну вот подумайте сами, разве можно локализовать волну в ТОЧКЕ пространства?! Волна ВСЕГДА занимает некоторый объём, а определение направления движения волны "в середине" вообще невозможно, если мы не "перекроем" волну с одного края.